水产货运有多种方法，以下是一些常见的方式：
干运
也称为无水运输法，将水冷却到使鱼虾暂停生命活动的温度，然后脱水运输。到达目的地后，再将鱼虾放入水中，它们会重新苏醒过来。在脱水状态下，其生命力可维持24小时以上。
淋水运输
适用于贻贝、扇贝、文蛤、牡蛎、青蟹等，运输途中要定时观察并喷淋海水。
帆布桶运输
采用粗帆布缝制成帆布桶，其底部多数为正方形，少数为圆形，长度与高度可据运输数量与车船体积而定，一般是0.8~1.2m。制成后涂刷石蜡，用铁架支撑，装运的数量可根据鱼虾个体大小、水温高低、运输时间长短等条件而定，一般每吨水可装成鱼100kg左右。用火车、汽车、马车或船只运输均可，途中采取换水的方法以补充氧气，所换水的水质一定要事先处理好，以免发生意外。一般运程可达6天。如果经常给桶内充气或充氧，运程则更长。
塑料袋包装运输
把活鱼虾消毒，在塑料袋中装入配备好的水，再将鱼虾按不同规格和数量装入，然后挤掉袋中的空气，并灌入适量氧气，用橡皮圈束紧袋口。此法目前在世界各地广泛采用，安全系数大。
冷冻运输
采用专用冷冻运输箱装运活鱼。一般运输箱绝热怪采用20cm厚的聚氨酯板，用不锈钢制成骨架，注入大约100L海水和90L水，再将体积相当于800L的鱼和90L的冰放入箱中。
封闭充氧运输鱼苗、鱼种
使用容器具如塑料袋、橡皮胶囊等。装运方法包括加水、装鱼、排除空气和充入氧气、扎口和包装等步骤。运输途中应随时检查塑料袋是否漏水和漏气，及时采取措施。如果运输时间长或温度高，可采取换水、换气和加冰块、泼凉水等方法解决。
其他方法
短途运输：例如，活对虾可以放入冷却池中，使池水温度缓慢降至12~14℃，然后捞出装箱；活甲鱼可以用湿蒲包加盖装运；活泥鳅可以用尼龙纺织袋等较严实的袋子装运，但要湿透水；活鳝鱼可以用水充分淋湿鱼体后盛入湿蒲包内并扎口，再放入加盖的鱼篓中。
长途运输：例如，甲鱼在运输前需要禁食2~3天，排粪并保持清洁卫生；活鱼可以采用安眠运输，即在水中注入二氧化碳和氧气各50%，使鱼处于昏睡状态；活蟹可以在篓中铺层沙并撒些芝麻或鸡蛋，然后加盖运输；泥鳅可以置于5℃环境中进行长途运输。
选择合适的运输方式需要考虑货物的特性、运输时间、成本以及目的地等因素。每种方法都有其优缺点，例如干运节省运费但需要特殊的设备和条件，而冷冻运输则适合长时间保存但成本较高。